服务特色
 　　长期以来,实验室根据国家经济建设和科学教育事业发展的需要，立足于国际学科发展的先进理论和技术前沿，结合我国丰富的物种资源，逐步形成了以生物大分子与生物药物研究、植物分子生物学研究、植物与微生物相互作用研究和生物信息与基因进化研究等四个主要研究方向，致力于尽快将现代生物工程新技术、新方法应用于农业、工业和医药生产实践，已经具备了较强的承担国家级重大科研任务的能力，常年承担“973”、“863”和国家自然科学基金重点项目20项左右，近5年年均科研经费达到1800万元。
　　建室20多年来，本室科研人员主要在蓝藻异型胞分化与模式形成机制研究，棉花转录组学研究，拟南芥和水稻功能基因研究，AK6、AtWRKY1和DctB等重要生物大分子的晶体学及结构功能研究，蛋白－蛋白相互作用研究，蛋白质构像与功能关系研究，植物抗病机制研究，生物信息平台和数据库建设、生物信息学新算法研发以及统计学规律发现等领域取得了重要进展和突破。

科研队伍和骨干专家 

1.科研队伍
　　实验室现有各类科研人员50人，有独立运行的课题组20个，有教授、博士生导师21人（其中院士2人，“长江计划”特聘教授5人，国家杰出青年科学基金获得者8人），博士副教授4人，另有技术及管理人员5人。科研人员中34人拥有博士学位。以朱玉贤为学术带头人在2003年获得国家自然科学基金委“创新研究团队”一个，在2006年获得延续资助。
2.骨干专家
　　朱玉贤，教授。1982年7月本科毕业于浙江农业大学；1989年12月在美国康奈尔大学植物科学系获得博士学位，并去华盛顿大学生物系做博士后。现任北京大学生命科学学院蛋白质工程及职务基因工程国家重点实验室主任，长江学者、教授，博士生导师。主要研究方向是植物分子生物学、基因调控、基因工程疫苗。
　　许智宏，硕士。1959年9月至1965年8月在北京大学生物系植物学专业学习，1965年至1969年在中国科学院上海植物生理研究所攻读硕士学位。现任蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室学术委员会主任，北京大学生命科学学院教授，中国科学院院士，北京大学前校长。主要研究方向是植物发育生物学、植物组织和细胞培养、原生质体操作和植物遗传化植物生物工程。

科研成果 

【主要成果名称、简介和主要用途】
　　系统研究了纤维伸长期转录组变化规律，首次发现植物激素乙烯参与调控棉纤维细胞伸长，揭示了棉纤维发育的分子机制，为大幅度提高棉纤维品质提供了理论依据；构建了高质量陆地棉胚珠cDNA文库，有93，730条棉花EST序列被NCBI收录，占世界现有棉花EST总量约25％。获得28，141条UniEST，占全世界陆地棉UniEST数的70%左右。
【应用领域】农作物（棉花）生产
【产业化情况】不详
【专利情况】
　　天花粉蛋白突变体及其编码基因（ZL 200410074324.6）新的草甘膦耐受型5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合成酶及其编码基因（ZL 02117991.3）等（该实验室拥有大量专利，依其网站公布资料，03年至今计39项。

代表仪器设备

名称1： 全自动DNA序列分析仪
原值（万元） 65.25
厂商及型号： Applied Biosystems/310型
主要性能参数： 1.检测灵敏度高：可使用荧光标记HEX、TAM或是用溴化忆锭标记DNA，使用荧光标记能检测100attomoles的DNA，使用溴化忆锭能检测到500attomoles的DNA
2.胶板可重复使用：不需要每跑完一次样品就重新制胶，制好的胶板在不减少分辨率的情况下可反复使用10次以上。并且胶板可长保存一个星期左右，只需要每天用时更换缓冲液；
3.超薄的18cm胶板：胶板只有18cm长，胶体的厚度只有0.25毫米，减少样本的检测所需时间，以便能在一定的时间检测更多样本，同时减少“笑”带的产生，提高图像的质量。
功能用途： 具有DNA测序、PCR片段大小分析和定量分析功能,并且实现了全部操作自动化，包括自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析。

名称2： 脉冲电泳仪
原值（万元） 9.88
厂商及型号： HY-DYY-5B
主要性能参数： 1.交变时间：0.01秒–99小时99分，连续可调双路转换时间，数字显示，采用集成电路装置。
2.输出电压：0–600V 连续可调
3.输出电流：0–500mA 连续可调 4.电源电压：220V 50Hz
5.消耗工率：约150W
功能用途： DYY-5B交变脉冲电泳仪是一种可用来分离染色体大分子DNA的新的凝胶电泳方法。通过交替采用两个不同方向的不均匀电场，使DNA分子在挤过凝胶筛孔时不断改变方向，从而获得大分子DNA的分辨率电泳，该仪器进行脉冲电场凝胶电泳分离酵母染色体DNA，可分成11个条带，用自身连接入DNA作为分子量标准物，可分出14个条带，均获得较好分离效果。